RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	STX17	P56962	302 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GRIK3	Q13003	919 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	DGKZ	Q13574	1117 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MREG	Q8N565	214 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	RAD54L	Q92698	747 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	LENG9	Q96B70	501 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJC7	Q99615	494 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SH3GL3	Q99963	347 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF536	O15090	1300 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PQC6	194 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	BACE1	P56817	501 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	HYI	Q5T013	277 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	NLRP14	Q86W24	1093 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	KLRG1	Q96E93	195 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FAM20A	Q96MK3	541 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GDA	Q9Y2T3	454 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		16.74	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FLOT1	O75955	427 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	NR1D1	P20393	614 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	VAV2	P52735	878 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ASIC1	P78348	528 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FUK	Q8N0W3	1084 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM58	Q8NG06	486 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	UIMC1	Q96RL1	719 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	STIM2	Q9P246	746 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FZD1	Q9UP38	647 aa		16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PAX7	P23759	505 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PRCP	P42785	496 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PAK1	Q13153	545 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ENC1	O14682	589 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MSH4	O15457	936 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ABL1	P00519	1130 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FDX1	P10109	184 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	KRT31	Q15323	416 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ECM1	Q16610	540 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CEP57	Q86XR8	500 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ADSSL1	Q8N142	457 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	NELFB	Q8WX92	580 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	EXOC1	Q9NV70	894 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PNMA2	Q9UL42	364 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	STK24	Q9Y6E0	443 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		16.72	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MYMK	A6NI61	221 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	C19orf81	C9J6K1	198 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ZBED4	O75132	1171 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GHR	P10912	638 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	IDE	P14735	1019 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	HSD17B4	P51659	736 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PDE4D	Q08499	809 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	XRCC4	Q13426	336 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MEA1	Q16626	185 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP58	Q5T655	872 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	16.71	■□□□□ 0.27
BBS1-225	ENST00000630659	KCNK18	Q7Z418	384 aa		16.71	■□□□□ 0.27

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