RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	ENPP3	O14638	875 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRT40	Q6A162	431 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	NEK8	Q86SG6	692 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	OXER1	Q8TDS5	423 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMD10	O75832	226 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PADI3	Q9ULW8	664 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	MARCH6	O60337	910 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	C22orf31	O95567	290 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	OAT	P04181	439 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOSB	P53539	338 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRKCE	Q02156	737 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	THEG	Q9P2T0	379 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRT2	P35908	639 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	UGCG	Q16739	394 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	MBOAT7	Q96N66	472 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAGEB2	O15479	319 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC37A4	O43826	429 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF862	O60290	1169 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRIM29	Q14134	588 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	RDM1	Q8NG50	284 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	JAK2	O60674	1132 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	LPXN	O60711	386 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPS6KA5	O75582	802 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	VTN	P04004	478 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMOD1	P28289	359 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLCN3	P51790	818 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	FIBCD1	Q8N539	461 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAP7D2	Q96T17	732 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	AKT3	Q9Y243	479 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	SI	P14410	1827 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	NR5A1	Q13285	461 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	SAMD11	Q96NU1	681 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	EPC2	Q52LR7	807 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	ODR4	Q5SWX8	454 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM20A	Q96MK3	541 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	OSMR	Q99650	979 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM205C	A6NFA0	338 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	C8orf34	Q49A92	452 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTERF2	Q49AM1	385 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	XKR3	Q5GH77	459 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM192	Q8IY95	271 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	BANK1	Q8NDB2	785 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	IL27	Q8NEV9	243 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCLT1	Q96NL6	688 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	DENND3	A2RUS2	1198 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR182	O15218	404 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	STAG3L1	P0CL83	205 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMX1	Q9H3N1	280 aa		32.6	■■■□□ 2.81

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