RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL23Q8NBE8 558 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 ERVK-5Q9HDB9 667 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF302Q9NR11 478 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 COL1A2P08123 1366 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 SARSP49591 514 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 GATMP50440 423 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 CDHR5Q9HBB8 845 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 LRFN2Q9ULH4 789 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 GINS2Q9Y248 185 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 ATP4AP20648 1035 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 SWSAP1Q6NVH7 229 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM40Q8WWA1 233 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2R3CQ969Q6 453 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1671Q9BY89 1806 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 MGEA5O60502 916 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 RPS6KA5O75582 802 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 IRS1P35568 1242 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 POF1BQ8WVV4 589 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CD207Q9UJ71 328 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 PIEZO1Q92508 2521 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ESYT2A0FGR8 921 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS3O15072 1205 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 MSLNLQ96KJ4 702 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 UIMC1Q96RL1 719 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM2Q99965 735 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 RGS18Q9NS28 235 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D22BQ9NU19 505 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CDC45O75419 566 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ODR4Q5SWX8 454 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 MCTP2Q6DN12 878 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 EFHBQ8N7U6 833 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf112Q9NSG2 853 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 DENND3A2RUS2 1198 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 GPR182O15218 404 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 C22orf31O95567 290 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 EYA4O95677 639 aa28.29■■■□□ 2.12
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PTPRF-216ENST00000617451 NDUFV1P49821 464 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 FGD1P98174 961 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 SLC24A5Q71RS6 500 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf50Q9HD87 102 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 EVPLQ92817 2033 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 C9IYK1 514 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CPA1P15085 419 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 APOBRQ0VD83 1088 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 PKN1Q16512 942 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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PTPRF-216ENST00000617451 CLEC1BQ9P126 229 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 KIZQ2M2Z5 673 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 FAM102BQ5T8I3 360 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZUG5 572 aa28.27■■■□□ 2.12
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PTPRF-216ENST00000617451 WDFY4Q6ZS81 3184 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRF-216ENST00000617451 TBKBP1A7MCY6 615 aa28.26■■■□□ 2.11
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PTPRF-216ENST00000617451 GPR32O75388 356 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 NRIP1P48552 1158 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 FAM189BP81408 668 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 UBE3AQ05086 875 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 FAM228AQ86W67 206 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 METTL13Q8N6R0 699 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R16BQ96T49 567 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 OSMRQ99650 979 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 AAASQ9NRG9 546 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRF-216ENST00000617451 NID2Q14112 1375 aa28.25■■■□□ 2.11
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