RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.05□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 TNMDQ9H2S6 317 aa14.05□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 HAS3O00219 553 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 GAS7O60861 476 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP1P03956 469 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 INSRRP14616 1297 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 PBX2P40425 430 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 CDHR1Q96JP9 859 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 AZI2Q9H6S1 392 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 STK36Q9NRP7 1315 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO7AQ13402 2215 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MARCH6O60337 910 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MYOGP15173 224 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MCM7P33993 719 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 STAT5BP51692 787 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 RABGGTBP53611 331 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 PPFIA1Q13136 1202 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 BANK1Q8NDB2 785 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 TRANK1O15050 2925 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP4AP20648 1035 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MBTPS1Q14703 1052 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB9Q96C00 473 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 KAT6AQ92794 2004 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 EML1O00423 815 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB39O15060 712 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP3A4P08684 503 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 CKBP12277 381 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP4A11Q02928 519 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF174Q15697 407 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 NEK8Q86SG6 692 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 MAF1Q9H063 256 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 KPNA6O60684 536 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 GPNMBQ14956 572 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 PLCB4Q15147 1175 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIK4Q16099 956 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM240Q5SV17 173 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRED2Q7Z698 418 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM199Q8N511 208 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 NR1I2O75469 434 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 IQCF3P0C7M6 154 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 WASF1Q92558 559 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFRSF25Q93038 417 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 DISC1Q9NRI5 854 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 LTBP2Q14767 1821 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF862O60290 1169 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 NBNO60934 754 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPN2P17655 700 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 RETREG2Q8NC44 543 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 HAS1Q92839 578 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CERS4Q9HA82 394 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CBX8Q9HC52 389 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF302Q9NR11 478 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 RGL1Q9NZL6 768 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 POTEB3A0JP26 581 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 TXKP42681 527 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 POTEBQ6S5H4 581 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 METTL13Q8N6R0 699 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CIITAP33076 1130 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 USP11P51784 963 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF710Q8N1W2 664 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 POLD4Q9HCU8 107 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 BRMS1Q9HCU9 246 aa14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms