RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	MTA1	Q13330	715 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MUM1	Q2TAK8	710 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CREG2	Q8IUH2	290 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TCP11	Q8WWU5	503 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KCND2	Q9NZV8	630 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DISP2	A7MBM2	1401 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MST1R	Q04912	1400 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	C6orf229	H3BNL8	230 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790		I3L4J1	428 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LCA5L	O95447	670 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM253	P0C7T8	217 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PLTP	P55058	493 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RWDD2B	P57060	319 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MXRA7	P84157	204 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PPP2R5A	Q15172	486 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PKN1	Q16512	942 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	C12orf60	Q5U649	245 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	VPS52	Q8N1B4	723 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC89	Q8N998	374 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PIGB	Q92521	554 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	AMN	Q9BXJ7	453 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790		A0A0G2JLW4	131 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	STXBP3	O00186	592 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	COBL	O75128	1261 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PHF2	O75151	1096 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CHGB	P05060	677 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KRT15	P19012	456 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	GPC5	P78333	572 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MAP7	Q14244	749 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DCAF4	Q8WV16	495 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	NACC1	Q96RE7	527 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SH3GL3	Q99963	347 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	BTG4	Q9NY30	223 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	STOML1	Q9UBI4	398 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SCOC	Q9UIL1	159 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SUFU	Q9UMX1	484 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CASZ1	Q86V15	1759 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	POTEF	A5A3E0	1075 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790		E7ENQ6	273 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	P4HA2	O15460	535 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RAD51C	O43502	376 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ZWINT	O95229	277 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	POTEI	P0CG38	1075 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MYBL1	P10243	752 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MUT	P22033	750 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SOX5	P35711	763 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	HSD17B3	P37058	310 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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