RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 DPYDQ12882 1025 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 RNF180Q86T96 592 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 CEP170P1Q96L14 293 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 ARSHQ5FYA8 562 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 GPBP1Q86WP2 473 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 TRIM9Q9C026 710 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 MYADML2A6NDP7 307 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 CYP11B2P19099 503 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 RARRES1P49788 294 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 SPATA20Q8TB22 786 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 ADAMTS4O75173 837 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 SMC2O95347 1197 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 NPEPPSP55786 919 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 CHMP4BP1P59074 171 aa25.17■■□□□ 1.62
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ACTN4-210ENST00000588618 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 PLCB4Q15147 1175 aa25.16■■□□□ 1.62
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ACTN4-210ENST00000588618 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 KCND2Q9NZV8 630 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 HBP1O60381 514 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 ASIC1P78348 528 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 NKX3-2P78367 333 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 PADI6Q6TGC4 694 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 DYMQ7RTS9 669 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 DDX12PQ92771 950 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 MYH11P35749 1972 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 KLRC4O43908 158 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 F2P00734 622 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 CCL5P13501 91 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 SMARCE1Q969G3 411 aa25.15■■□□□ 1.62
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ACTN4-210ENST00000588618 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-210ENST00000588618 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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ACTN4-210ENST00000588618 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 MTFR1Q15390 333 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 PPME1Q9Y570 386 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 MFSD10Q14728 455 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 LHX8Q68G74 356 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 DEFB118Q96PH6 123 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 CEP89Q96ST8 783 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 POLD4Q9HCU8 107 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 BIN1O00499 593 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 DGAT1O75907 488 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 IDEP14735 1019 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 KCNA10Q16322 511 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 KAT2BQ92831 832 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.12■■□□□ 1.61
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ACTN4-210ENST00000588618 BMP6P22004 513 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.12■■□□□ 1.61
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ACTN4-210ENST00000588618 ISM2Q6H9L7 571 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF333Q96JL9 665 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 REEP2Q9BRK0 252 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 KAT6AQ92794 2004 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 PSEN2P49810 448 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF445P59923 1031 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 PPFIA1Q13136 1202 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN4-210ENST00000588618 GIT2Q14161 759 aa25.11■■□□□ 1.61
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