RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 SCN5AQ14524 2016 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 MYH6P13533 1939 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 A0A087WZ62 844 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 STK25O00506 426 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 RPS6KA5O75582 802 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 KCNA2P16389 499 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 IRS1P35568 1242 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 AAMPQ13685 434 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 BLIDQ8IZY5 108 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PPTC7Q8NI37 304 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 CPB2Q96IY4 423 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 CEP170P1Q96L14 293 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 KAT6AQ92794 2004 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 H3BQV1 296 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 KIAA0355O15063 1070 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ZNF862O60290 1169 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 CD4P01730 458 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 KRT76Q01546 638 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 VWCEQ96DN2 955 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 CTDNEP1O95476 244 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TPM2P07951 284 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ACTN1P12814 892 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 EDNRBP24530 442 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ARPP19P56211 112 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 FUT2Q10981 343 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 CEP57Q86XR8 500 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 IWS1Q96ST2 819 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PLXNB2O15031 1838 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 GRM6O15303 877 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 LGR5O75473 907 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 F2P00734 622 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 AKAP5P24588 427 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 GNA11P29992 359 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PRKCEQ02156 737 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ABI1Q8IZP0 508 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 DYDC2Q96IM9 177 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 C8orf76Q96K31 380 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 MYH7P12883 1935 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 LINC01565O15544 149 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ATP4AP20648 1035 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TAP1Q03518 808 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 NTRK3Q16288 839 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TCHPQ9BT92 498 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 JADE2Q9NQC1 790 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 MGEA5O60502 916 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PAK2Q13177 524 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 GRB10Q13322 594 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TMC7Q7Z402 723 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ZBTB33Q86T24 672 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 EVPLQ92817 2033 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms