RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540719.1

QKI-211, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 2

Gene QKI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-211	ENST00000540719	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	HYAL1	Q12794	435 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PHKB	Q93100	1093 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719		C9IYK1	514 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ITGB1	P05556	798 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	CTNNB1	P35222	781 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	DSC3	Q14574	896 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	FAM228A	Q86W67	206 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	MBOAT7	Q96N66	472 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	CEP89	Q96ST8	783 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	C6orf50	Q9HD87	102 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ZNF302	Q9NR11	478 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	RGS18	Q9NS28	235 aa		9.99	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	MSH4	O15457	936 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	NCK2	O43639	380 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PSMD10	O75832	226 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	STBD1	O95210	358 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	CYP3A7	P24462	503 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	GNA11	P29992	359 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ZNF76	P36508	570 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	GATM	P50440	423 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	USP11	P51784	963 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PAK2	Q13177	524 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ADAM15	Q13444	863 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	RUFY3	Q7L099	469 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	GJD3	Q8N144	294 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SLC5A5	Q92911	643 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	UIMC1	Q96RL1	719 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	RIT2	Q99578	217 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	RNF19A	Q9NV58	838 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		9.98	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719		M0QZ92	97 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	BACH1	O14867	736 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PPFIA3	O75145	1194 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	TBX10	O75333	385 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PSAP	P07602	524 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	STAG3L1	P0CL83	205 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PSMA5	P28066	241 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	IRS1	P35568	1242 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ZP2	Q05996	745 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	UGCG	Q16739	394 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719		Q4G0T1	1027 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	PRR16	Q569H4	304 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	BICD2	Q8TD16	824 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ADAM2	Q99965	735 aa		9.97	□□□□□ -0.81
QKI-211	ENST00000540719	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms