RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 SQORQ9Y6N5 450 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-204ENST00000528201 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 GAS7O60861 476 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMD10O75832 226 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 CDKL5O76039 1030 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 TFF2Q03403 129 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ME3Q16798 604 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 INF2Q27J81 1249 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM266Q2M3C6 531 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 LRCH2Q5VUJ6 765 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 NME8Q8N427 588 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 OXER1Q8TDS5 423 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM40Q8WWA1 233 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 SAMM50Q9Y512 469 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 M0QZ92 97 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC00271P0C7V0 271 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 EPC2Q52LR7 807 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 B3GNT9Q6UX72 402 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ETNPPLQ8TBG4 499 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 COL4A6Q14031 1691 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC37A4O43826 429 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R16BQ96T49 567 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 TEKT3Q9BXF9 490 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 GINS2Q9Y248 185 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 PRKCEQ02156 737 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 PAK2Q13177 524 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD1Q15327 319 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 MOXD1Q6UVY6 613 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 KRT25Q7Z3Z0 450 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ERVK-5Q9HDB9 667 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 OATP04181 439 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 KIZQ2M2Z5 673 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 GTF3C6Q969F1 213 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 MGEA5O60502 916 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 VTNP04004 478 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 CLCN3P51790 818 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 NEK4P51957 841 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 JAK3P52333 1124 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ST3GAL1Q11201 340 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 LETM2Q2VYF4 491 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM192Q8IY95 271 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 METTL13Q8N6R0 699 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM167AQ96KS9 214 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM205CA6NFA0 338 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 GPR32O75388 356 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 DGKIO75912 1065 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 STBD1O95210 358 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 SFNP31947 248 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC71Q8N4P6 559 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 OSMRQ99650 979 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM150BA6NC51 233 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNQ1P51787 676 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 MIER3Q7Z3K6 550 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 FIBCD1Q8N539 461 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 SAMD11Q96NU1 681 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP131Q9UPN4 1083 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 H3BNC9 293 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 JAK2O60674 1132 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 RPS6KA5O75582 802 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 GATMP50440 423 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM228AQ86W67 206 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 RDM1Q8NG50 284 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 TNFRSF25Q93038 417 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 VAV3Q9UKW4 847 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC3P53804 2025 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 EML1O00423 815 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 BMP1P13497 986 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 NR5A1Q13285 461 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 GPM6BQ13491 265 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-204ENST00000528201 NEK8Q86SG6 692 aa26.98■■□□□ 1.91
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