RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514822.1

PHF3-211, Transcript of PHD finger protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene PHF3, Length 486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3-211ENST00000514822 SLFN13Q68D06 897 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 E2F7Q96AV8 911 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 SCYL1Q96KG9 808 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ACSS2Q9NR19 701 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.69□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 HMGCRP04035 888 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 CD83Q01151 205 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 KANK2Q63ZY3 851 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 LOXL4Q96JB6 756 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 SAMD11Q96NU1 681 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 FEZ1Q99689 392 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.68□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 A0A0G2JNJ9 132 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 DVL2O14641 736 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 CYP17A1P05093 508 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 KCNQ1P51787 676 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 NEK4P51957 841 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 NIM1KQ8IY84 436 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 FOXB1Q99853 325 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 Q9UFV3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 PLAAQ9Y263 795 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.67□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 KPNA6O60684 536 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ADRB1P08588 477 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 RRADP55042 308 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 MAP3K12Q12852 859 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 MOGSQ13724 837 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 KIF18BQ86Y91 864 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 CHST13Q8NET6 341 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.66□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 GAS7O60861 476 aa6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 ROM1Q03395 351 aa6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 NME9Q86XW9 330 aa6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 LMF1Q96S06 567 aa6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 PTPN18Q99952 460 aa6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.65□□□□□ -1.34
PHF3-211ENST00000514822 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 ENPP3O14638 875 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 GPR42O15529 346 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 PRLP01236 227 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 SLC9A1P19634 815 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 MEOX1P50221 254 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 MFSD3Q96ES6 412 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 MAML3Q96JK9 1138 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 C16orf92Q96LL3 132 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 IFT57Q9NWB7 429 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 F2P00734 622 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 RAC3P60763 192 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 ADAM17P78536 824 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 NFKB2Q00653 900 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 SLC6A3Q01959 620 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 PCOLCEQ15113 449 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 EPHA7Q15375 998 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 TTC38Q5R3I4 469 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.351e-8■■□□□ 14
PHF3-211ENST00000514822 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 AHI1Q8N157 1196 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 C8orf49Q96NF6 230 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 TBX22Q9Y458 520 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 FAM83GA6ND36 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 RGS3P49796 1198 aa6.62□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 ADCY1Q08828 1119 aa6.62□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 RNF151Q2KHN1 245 aa6.62□□□□□ -1.35
PHF3-211ENST00000514822 AGBL4Q5VU57 503 aa6.62□□□□□ -1.35
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