RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LPIN1Q14693 890 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP2R2DQ66LE6 453 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPAINQ86UA6 219 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 METTL13Q8N6R0 699 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BANK1Q8NDB2 785 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRDM12Q9H4Q4 367 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CERS4Q9HA82 394 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GINS2Q9Y248 185 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.63□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM150BA6NC51 233 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIF28PB7ZC32 967 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EML1O00423 815 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGEF15O94989 841 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OATP04181 439 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FOSL2P15408 326 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IER5Q5VY09 327 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HAS1Q92839 578 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM167AQ96KS9 214 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM20AQ96MK3 541 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SH2D3AQ9BRG2 576 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NRBP2Q9NSY0 501 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VAV3Q9UKW4 847 aa13.62□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LCHNA4D1U4 455 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EFCAB14O75071 495 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UPP2O95045 317 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BAG4O95429 457 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C22orf31O95567 290 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AMHP03971 560 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VTNP04004 478 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CD52P31358 61 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLCN3P51790 818 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRC71Q8N4P6 559 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RDM1Q8NG50 284 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.61□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RFXAPO00287 272 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GJB5O95377 273 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MCM7P33993 719 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP2R5CQ13362 524 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CALCRLQ16602 461 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIZQ2M2Z5 673 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MTERF2Q49AM1 385 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPRED2Q7Z698 418 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NME8Q8N427 588 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 APBB2Q92870 758 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SUGCTQ9HAC7 445 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CEP131Q9UPN4 1083 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 COL6A3P12111 3177 aa13.6□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TBX3O15119 743 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NEMFO60524 1076 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGFBP4P22692 258 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TXKP42681 527 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TAP1Q03518 808 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLA2G4FQ68DD2 849 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAD9AQ99638 391 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RGL1Q9NZL6 768 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AKT3Q9Y243 479 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDH23Q9H251 3354 aa13.59□□□□□ -0.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAGEB2O15479 319 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STBD1O95210 358 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 QARSP47897 775 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PSMC5P62195 406 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP4A11Q02928 519 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PAK2Q13177 524 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF174Q15697 407 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 XKR3Q5GH77 459 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HSCBQ8IWL3 235 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLFN12Q8IYM2 578 aa13.58□□□□□ -0.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms