RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 KCNJ15Q99712 375 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 HDAC8Q9BY41 377 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RNF208Q9H0X6 261 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 EDARQ9UNE0 448 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SHISA3A0PJX4 238 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 K7ENM7 598 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KCNK3O14649 394 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FRS3O43559 492 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ORC4O43929 436 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 WISP1O95388 367 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CYP7A1P22680 504 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 STT3AP46977 705 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 MAPK10P53779 464 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZNF543Q08ER8 600 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 VPS53Q5VIR6 699 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DAAM2Q86T65 1068 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PPM1NQ8N819 430 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DLG3Q92796 817 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 APIPQ96GX9 242 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.76□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 MAN2B1O00754 1011 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SCDO00767 359 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TMEM253P0C7T8 217 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 EPXP11678 715 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TSHRP16473 764 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 EDNRBP24530 442 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TERF1P54274 439 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PRKG2Q13237 762 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 GAS6Q14393 721 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 STARD3Q14849 445 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 EPHA7Q15375 998 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 MUM1Q2TAK8 710 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CPZQ66K79 652 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RFX8Q6ZV50 586 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 OR8H2Q8N162 312 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZNF527Q8NB42 609 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DAGLBQ8NCG7 672 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CXorf38Q8TB03 319 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RAX2Q96IS3 184 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 C16orf92Q96LL3 132 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 LRRC27Q9C0I9 530 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RIC8AQ9NPQ8 531 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CLDND1Q9NY35 253 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.75□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PRQ8 180 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CCDC154A6NI56 674 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms