RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491824.1

HCLS1-210, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 3

Gene HCLS1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-210ENST00000491824 ERMNQ8TAM6 284 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 NEK9Q8TD19 979 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 HAS1Q92839 578 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 MTMR6Q9Y217 621 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 AMHP03971 560 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 DNAJB2P25686 324 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 DNM2P50570 870 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 EPHA7Q15375 998 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 B3GNT9Q6UX72 402 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 DEFB123Q8N688 67 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 BANK1Q8NDB2 785 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 TIFAQ96CG3 184 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 SCLT1Q96NL6 688 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 RAB34Q9BZG1 259 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-210ENST00000491824 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 C22orf31O95567 290 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 BRD1O95696 1058 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 OR52Z1P0C646 297 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 GHRP10912 638 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ATP4AP20648 1035 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 UGCGQ16739 394 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 BRAPQ7Z569 592 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 LXNQ9BS40 222 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 AKT3Q9Y243 479 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 GINS2Q9Y248 185 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 PPME1Q9Y570 386 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 SQORQ9Y6N5 450 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF862O60290 1169 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 CDC42EP1Q00587 391 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 MBTPS1Q14703 1052 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF174Q15697 407 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 MTERF2Q49AM1 385 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 STK24Q9Y6E0 443 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 SCN5AQ14524 2016 aa18.5■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 EML1O00423 815 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 LAD1O00515 517 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 CHRNA1P02708 482 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 PAK2Q13177 524 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 HAUS3Q68CZ6 603 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 TLL1O43897 1013 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 CYP4A11Q02928 519 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 MGAT3Q09327 533 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 ATL3Q6DD88 541 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 TPH2Q8IWU9 490 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 C4orf19Q8IY42 314 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 DYDC2Q96IM9 177 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 CEP170P1Q96L14 293 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 MTMR9Q96QG7 549 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 PBX4Q9BYU1 374 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 LAMA3Q16787 3333 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 RFC5P40937 340 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 CLCN3P51790 818 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 LPIN1Q14693 890 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 GPNMBQ14956 572 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 PPP2R2DQ66LE6 453 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-210ENST00000491824 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms