RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM9Q9C026 710 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CAND2O75155 1236 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KRT13P13646 458 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PLTPP55058 493 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 NFIAQ12857 509 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TATDN2Q93075 761 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 H0Y3Z8 333 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 M0R2N6 131 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KIF3CO14782 793 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 LGR5O75473 907 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PRLRP16471 622 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 MXRA7P84157 204 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 BIRC3Q13489 604 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SNX29Q8TEQ0 813 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 NEUROG2Q9H2A3 272 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ABCF3Q9NUQ8 709 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ITGA4P13612 1032 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PSMD2Q13200 908 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 XRCC4Q13426 336 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ZFPM1Q8IX07 1006 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L15C9J2P7 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L13C9JLJ4 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L11C9JVI0 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L18D6R9N7 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L22D6RA61 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L17D6RBQ6 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L19D6RCP7 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L20D6RJB6 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ADCY7P51828 1080 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ATP11AP98196 1134 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L24Q0WX57 530 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L6PQ6QN14 398 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PEX26Q7Z412 305 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CERS5Q8N5B7 392 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PLCB1Q9NQ66 1216 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 AFF2P51816 1311 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SCN7AQ01118 1682 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L10C9JJH3 530 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 UBOX5O94941 541 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CCT6BQ92526 530 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ECT2Q9H8V3 914 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SESN3P58005 492 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 USP38Q8NB14 1042 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TTYH3Q9C0H2 523 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 NRAPQ86VF7 1730 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 RTN2O75298 545 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PLCG2P16885 1265 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SLC8A3P57103 927 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ITIH3Q06033 890 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KBTBD4Q9NVX7 518 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 MTMR4Q9NYA4 1195 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 MGRN1O60291 552 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 MTMR3Q13615 1198 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TCERG1LQ5VWI1 586 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SV2BQ7L1I2 683 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ERICH1Q86X53 443 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 AZI2Q9H6S1 392 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 WNK3Q9BYP7 1800 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087X0T9 212 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 FAM228BP0C875 321 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 MIIPQ5JXC2 388 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SPZ1Q9BXG8 430 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ISCUQ9H1K1 167 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM33Q9UPN9 1127 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SHBGP04278 402 aa17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 DRD4P21917 467 aa17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KCNK18Q7Z418 384 aa17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRF4Q8IZF3 695 aa17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC26Q8TAB7 109 aa17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TSC22D3Q99576 134 aa17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 RNF14Q9UBS8 474 aa17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms