RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 POTEJP0CG39 1038 aa23.99■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 FIGNQ5HY92 759 aa23.99■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.99■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.99■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 DNERQ8NFT8 737 aa23.99■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.99■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 TGFB1I1O43294 461 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 GJA5P36382 358 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 KSR1Q8IVT5 923 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 RDM1Q8NG50 284 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 BACH1O14867 736 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 EPHB6O15197 1021 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 WDR59Q6PJI9 974 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 CDHR1Q96JP9 859 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 CHP1Q99653 195 aa23.98■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 NFASCO94856 1347 aa23.97■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 NR3C1P04150 777 aa23.97■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 GNPTABQ3T906 1256 aa23.97■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.97■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 A0A1W2PQJ5 194 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 GRIN3BO60391 1043 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 CCDC175P0C221 793 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 ZBED6P86452 979 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 STXBP2Q15833 593 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 ILDR2Q71H61 639 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 CLIC2O15247 247 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 SORBS3O60504 671 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 SP2Q02086 613 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 STRA6Q9BX79 667 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 UBE4BO95155 1302 aa23.95■■□□□ 1.43
USP13-202ENST00000482333 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 AKAP3O75969 853 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 NPEPPSP55786 919 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 KCNMA1Q12791 1236 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ANO5Q75V66 913 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 KIF18AQ8NI77 898 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.95■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 A0A0U1RQJ8 604 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ZNF862O60290 1169 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 PPP1R37O75864 691 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 SP4Q02446 784 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 MEA1Q16626 185 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 POTEB2H3BUK9 544 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 STBD1O95210 358 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 CASP4P49662 377 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ACTR2P61160 394 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 XKR9Q5GH70 373 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 IQCDQ96DY2 449 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.94■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 TUBB4AP04350 444 aa23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ICAM3P32942 547 aa23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 Q3C1V9 767 aa23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.93■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 FANCGO15287 622 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 PSAPP07602 524 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 EDNRBP24530 442 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.92■■□□□ 1.42
USP13-202ENST00000482333 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms