RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 CAGE1Q8TC20 777 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 RPTORQ8N122 1335 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 A0A087X0T9 212 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 BUB1O43683 1085 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 FAM228BP0C875 321 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF131P52739 623 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 TGFB2P61812 414 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 COG2Q14746 738 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ASIC2Q16515 512 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 SLC18A3Q16572 532 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 CREG2Q8IUH2 290 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 LPAR1Q92633 364 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 RIT2Q99578 217 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 NFKBIEO00221 500 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 MAP2K7O14733 419 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 USP14P54578 494 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 COG1Q8WTW3 980 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 BORCS6Q96GS4 357 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-205ENST00000479535 ERLIN1O75477 346 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 BCRP11274 1271 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 TNFAIP1Q13829 316 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 TERF2Q15554 542 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 ODR4Q5SWX8 454 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 WDR93Q6P2C0 686 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 PSMB7Q99436 277 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 ZMYND15Q9H091 742 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 L1RE1Q9UN81 338 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 NCK2O43639 380 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 FLOT1O75955 427 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 CXCR5P32302 372 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MTMR2Q13614 643 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 TNIP1Q15025 636 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 NOX5Q96PH1 765 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 SPAG5Q96R06 1193 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 KCND2Q9NZV8 630 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 HIP1RO75146 1068 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 GUCY2CP25092 1073 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 PTK2Q05397 1052 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 C2orf54Q08AI8 447 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 TKFCQ3LXA3 575 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 DAW1Q8N136 415 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 SIX2Q9NPC8 291 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 GCNT4Q9P109 453 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 TUBBP07437 444 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 PRLRP16471 622 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 VCAM1P19320 739 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 KLRC1P26715 233 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 GHRHRQ02643 423 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MAPK7Q13164 816 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 NFIL3Q16649 462 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 GBP6Q6ZN66 633 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MICALL2Q8IY33 904 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms