RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 IL17AQ16552 155 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM199Q8N511 208 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP170P1Q96L14 293 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 H0YGN5 161 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 M0QZ92 97 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP6R2O75170 966 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 MED24O75448 989 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 DDIT3P35638 169 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 THPOP40225 353 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 XKR9Q5GH70 373 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 ANO5Q75V66 913 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CALML4Q96GE6 196 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 C22orf31O95567 290 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 SELPP16109 830 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 RFC5P40937 340 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 RBL2Q08999 1139 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 POTEGQ6S5H5 508 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CABP7Q86V35 215 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 METTL13Q8N6R0 699 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP7D2Q96T17 732 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 PP2D1A8MPX8 630 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP2C18P33260 490 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 DNM2P50570 870 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 MFSD5Q6N075 450 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 NME8Q8N427 588 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 STBD1O95210 358 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CKBP12277 381 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 RFC2P35250 354 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 FPGSQ05932 587 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 IER5Q5VY09 327 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 RPAINQ86UA6 219 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CSRNP2Q9H175 543 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 DNM3Q9UQ16 869 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-212ENST00000472427 LTBP2Q14767 1821 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM150BA6NC51 233 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CDC25AP30304 524 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ME1P48163 572 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CCL23P55773 120 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 BADQ92934 168 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA32Q96LK8 384 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CUTAO60888 179 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 RSPH10BP0C881 870 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 NPEPPSP55786 919 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 AKT3Q9Y243 479 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ARID2Q68CP9 1835 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 DGAT1O75907 488 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CTSHP09668 335 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 RARRES1P49788 294 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms