RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PXMP2Q9NR77 195 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NENFQ9UMX5 172 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RCCD1A6NED2 376 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TLR2O60603 784 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GAS7O60861 476 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ATP9AO75110 1047 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TADA3O75528 432 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA10O95299 355 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 GNA14O95837 355 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNA2P16389 499 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN5P54829 565 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 AMPD2Q01433 879 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KCNA1Q09470 495 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GPR162Q16538 588 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 UGCGQ16739 394 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RDM1Q8NG50 284 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 GPRASP2Q96D09 838 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ERO1AQ96HE7 468 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TSG101Q99816 390 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 LXNQ9BS40 222 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RNF146Q9NTX7 359 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 FZD1Q9UP38 647 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NFASCO94856 1347 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PJA2O43164 708 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MARCH6O60337 910 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZBED4O75132 1171 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP3O75969 853 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KIF20AO95235 890 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.412e-7■■□□□ 13.3
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PTPRC-210ENST00000462363 YY1P25490 414 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ICAM3P32942 547 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF76P36508 570 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RARRES1P49788 294 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 VGLL4Q14135 290 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MYBPC2Q14324 1141 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 COG2Q14746 738 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PDXDC1Q6P996 788 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DLK2Q6UY11 383 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf19Q8IY42 314 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35C1Q96A29 364 aa6.23□□□□□ -1.41
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