RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 NME8Q8N427 588 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 USP38Q8NB14 1042 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 FAM167AQ96KS9 214 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 FAM205CA6NFA0 338 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 IGFBP4P22692 258 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 KRT2P35908 639 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 RDM1Q8NG50 284 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 ARNTL2Q8WYA1 636 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 TOP1MTQ969P6 601 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 SQORQ9Y6N5 450 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 TTC28Q96AY4 2481 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 M0QZ92 97 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 RFXAPO00287 272 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 PRKCEQ02156 737 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 INSL6Q9Y581 213 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXB3-202ENST00000460160 LINC01553A4QN01 128 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 MMP1P03956 469 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 OATP04181 439 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 CD52P31358 61 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 XIRP2A4UGR9 3374 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 FOSBP53539 338 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 UPP2O95045 317 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 KRT40Q6A162 431 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 FAM20AQ96MK3 541 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 VAV3Q9UKW4 847 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 HAS1Q92839 578 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 CDHR5Q9HBB8 845 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 PADI3Q9ULW8 664 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 BRWD1Q9NSI6 2320 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 BTBD18B2RXH4 712 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 ENPP3O14638 875 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 ERVK-21P61565 698 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 METTL13Q8N6R0 699 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 GINS2Q9Y248 185 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 COL4A6Q14031 1691 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 EML1O00423 815 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEB2O15479 319 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 PPP2R5CQ13362 524 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM29Q14134 588 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 POTEDQ86YR6 584 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 PPM1EQ8WY54 764 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 TBX3O15119 743 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 STBD1O95210 358 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 CLCN3P51790 818 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 PAK2Q13177 524 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM40Q8WWA1 233 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 YME1L1Q96TA2 773 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-202ENST00000460160 LPXNO60711 386 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 VTNP04004 478 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 GRB10Q13322 594 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 KIZQ2M2Z5 673 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 BANK1Q8NDB2 785 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R16BQ96T49 567 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 XKR3Q5GH77 459 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 TMX1Q9H3N1 280 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 NCOR1O75376 2440 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM150BA6NC51 233 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 GPR32O75388 356 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 CEP89Q96ST8 783 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms