RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447609.5

LMO3-209, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,365 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-209ENST00000447609 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 EP400Q96L91 3159 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 BCORQ6W2J9 1755 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 LRRD1A4D1F6 860 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 KLRF2D3W0D1 207 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 DEXIO95424 95 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MYL1P05976 194 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 GBP1P32455 592 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 SLC16A2P36021 539 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 AFMP43652 599 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PPP2R2AP63151 447 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ITIH4Q14624 930 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 NELFBQ8WX92 580 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 LRRC1Q9BTT6 524 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CCPG1Q9ULG6 757 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CXCL11O14625 94 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 AKR1B10O60218 316 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 SRGAP2O75044 1071 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CFBP00751 764 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MMP1P03956 469 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HSPA6P17066 643 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PEX19P40855 299 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 STAT2P52630 851 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 INHBEP58166 350 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PPATQ06203 517 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MYO1EQ12965 1108 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MEA1Q16626 185 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TBC1D10CQ8IV04 446 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 IQCKQ8N0W5 287 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FBF1Q8TES7 1133 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 IFT81Q8WYA0 676 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 KLRG1Q96E93 195 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PAGE5Q96GU1 130 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TSC22D3Q99576 134 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 EHD4Q9H223 541 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 VCXQ9H320 206 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 EBF2Q9HAK2 575 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 GINM1Q9NU53 330 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 EXOC1Q9NV70 894 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 A0A1W2PQJ5 194 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 C5orf60A6NFR6 353 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CCT8L1PA6NM43 557 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 STXBP3O00186 592 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 IRF6O14896 467 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TRAPPC3O43617 180 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 NMT2O60551 498 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PDHBP11177 359 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 RASA1P20936 1047 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 RCAN1P53805 252 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FIGNQ5HY92 759 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FAM160B2Q86V87 743 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ACER1Q8TDN7 264 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 WNK4Q96J92 1243 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TRIM47Q96LD4 638 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TRIM7Q9C029 511 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TTC26A0AVF1 554 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FOXN1O15353 648 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FESP07332 822 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PAEPP09466 180 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MYBL2P10244 700 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 IFNAR1P17181 557 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ZNF131P52739 623 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HERVK_113P62684 666 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms