RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 NOD2Q9HC29 1040 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 STK17AQ9UEE5 414 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GGA2Q9UJY4 613 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 C21orf2O43822 256 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 EDIL3O43854 480 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GANQ9H2C0 597 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 NAGPAQ9UK23 515 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ATP6V1G2O95670 118 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MMEP08473 750 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ABCB4P21439 1286 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GSTO1P78417 241 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MYO1EQ12965 1108 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC38Q502W7 563 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PBKQ96KB5 322 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PLTPP55058 493 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 AADACL2Q6P093 401 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC197Q8NCU1 140 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SNX24Q9Y343 169 aa16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 RASA1P20936 1047 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 AZI2Q9H6S1 392 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SBF2Q86WG5 1849 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CASP5P51878 434 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MGARPQ8TDB4 240 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ABCB11O95342 1321 aa16.78■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 UCHL3P15374 230 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 NR2F2P24468 414 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 DOK7Q18PE1 504 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CRY2Q49AN0 593 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC63Q8NA47 563 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 EYA3Q99504 573 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 POTEB3A0JP26 581 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 POTECB2RU33 542 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GFPT2O94808 682 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 LDHCP07864 332 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SLURP2P0DP57 97 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 STAT3P40763 770 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 XRCC4Q13426 336 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MTMR3Q13615 1198 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 LLGL1Q15334 1064 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 POTEBQ6S5H4 581 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GPBP1Q86WP2 473 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PROM2Q8N271 834 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 FMO2Q99518 471 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.77■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 LY75O60449 1722 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 C5orf60A6NFR6 353 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PPIP5K2O43314 1243 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SCNN1DP51172 638 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC14Q15048 493 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms