RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427786.1

PPP1CB-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-206ENST00000427786 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.14■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 DISC1Q9NRI5 854 aa22.14■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.14■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 SLC37A4O43826 429 aa22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 SFNP31947 248 aa22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 GRB10Q13322 594 aa22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TNFRSF25Q93038 417 aa22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 KIF2CQ99661 725 aa22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CD52P31358 61 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 JAK3P52333 1124 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 RDM1Q8NG50 284 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM167AQ96KS9 214 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 SAMM50Q9Y512 469 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CHMP2AO43633 222 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 JAK2O60674 1132 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 XBP1P17861 261 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 PRKCEQ02156 737 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 KRT40Q6A162 431 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 NEK8Q86SG6 692 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 WASF1Q92558 559 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 M0QZ92 97 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 ENPP3O14638 875 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 OATP04181 439 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 LINC00271P0C7V0 271 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 LETM2Q2VYF4 491 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 PPM1EQ8WY54 764 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TMX1Q9H3N1 280 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 VAV3Q9UKW4 847 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 PADI3Q9ULW8 664 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 MUC3AQ02505 3323 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM205CA6NFA0 338 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 DLL1O00548 723 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 STBD1O95210 358 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 NR5A1Q13285 461 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 YME1L1Q96TA2 773 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 UPP2O95045 317 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CEP89Q96ST8 783 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 THEGQ9P2T0 379 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP1CB-206ENST00000427786 MAGEB2O15479 319 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 GPR32O75388 356 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 MMP1P03956 469 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 KRT2P35908 639 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 PAK2Q13177 524 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 PPP2R5CQ13362 524 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 HAS1Q92839 578 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 ARID2Q68CP9 1835 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 EML1O00423 815 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 CLCN3P51790 818 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM20AQ96MK3 541 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 SAMD11Q96NU1 681 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 TBX3O15119 743 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 MGEA5O60502 916 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 DGKIO75912 1065 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 VTNP04004 478 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-206ENST00000427786 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms