RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 NR2E1Q9Y466 385 aa20.52■□□□□ 0.88
CITED2-201ENST00000367651 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CLIC2O15247 247 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 RAD21O60216 631 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SNAP25P60880 206 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SLC35C1Q96A29 364 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SWAP70Q9UH65 585 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 USP21Q9UK80 565 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 IFT88Q13099 833 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 QPCTQ16769 361 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 PRR16Q569H4 304 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SLF2Q8IX21 1173 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CERS5Q8N5B7 392 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 MBOAT7Q96N66 472 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 GCNT4Q9P109 453 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.51■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 MEIS2O14770 477 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 NR3C1P04150 777 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 FLOT1O75955 427 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 GFPT2O94808 682 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CYP3A7P24462 503 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 LENG9Q96B70 501 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 DPH5Q9H2P9 285 aa20.5■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 H2AFZP0C0S5 128 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CYP4A11Q02928 519 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CRY2Q49AN0 593 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 H2AFVQ71UI9 128 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 DAAM2Q86T65 1068 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 LRRC45Q96CN5 670 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 FAM196BA6NMK8 535 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 C6orf229H3BNL8 230 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 ARHGAP4P98171 946 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 HES6Q96HZ4 224 aa20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 FAM86B1E9PN63 330 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 PDXKO00764 312 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 RIMBP2O15034 1052 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 COPB2P35606 906 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SCNN1DP51172 638 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 GALCP54803 685 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SFI1A8K8P3 1242 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 H0YHG0 523 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 DNAJC18Q9H819 358 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 USP40Q9NVE5 1235 aa20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 TRAPPC3O43617 180 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 RPA1P27694 616 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 MNAT1P51948 309 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 NFIAQ12857 509 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 CEP89Q96ST8 783 aa20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CITED2-201ENST00000367651 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms