RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356825.8

SMAD2-202, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD2, Length 10,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-202ENST00000356825 TAGAPQ8N103 731 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ULK4Q96C45 1275 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MORF4L2Q15014 288 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 FAM160B2Q86V87 743 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 INTUQ9ULD6 942 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 HUS1O60921 280 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SERPINB2P05120 415 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZNF699Q32M78 642 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MAFGO15525 162 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 UBXN8O00124 270 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 CLIC2O15247 247 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PDIK1LQ8N165 341 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 HSPA4LO95757 839 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 CYP26B1Q9NR63 512 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 GDAQ9Y2T3 454 aa15.38■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PFKFB2O60825 505 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ASIC4Q96FT7 647 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 CFLARO15519 480 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 KCTD16Q68DU8 428 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 FAM167AQ96KS9 214 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SERPING1P05155 500 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 IL13P35225 146 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PSMD2Q13200 908 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 OTULINQ96BN8 352 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MAN2A1Q16706 1144 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MAP3K7CLP57077 242 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PYGBP11216 843 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 FSCBQ5H9T9 825 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ERICH1Q86X53 443 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 E9PMD0 336 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MXI1P50539 228 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 BEST2Q8NFU1 509 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TBX22Q9Y458 520 aa15.37■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SCOCQ9UIL1 159 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MAPK13O15264 365 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 CIAO1O76071 339 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 EPHB4P54760 987 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 IFT88Q13099 833 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ACAP3Q96P50 834 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 FANCLQ9NW38 375 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 KIAA0232Q92628 1395 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 MEIS1O00470 390 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 KRT8P05787 483 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ARL4DP49703 201 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZNF445P59923 1031 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ANO4Q32M45 955 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TBCKQ8TEA7 893 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 TMED1Q13445 227 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 C16orf87Q6PH81 154 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 KLHL29Q96CT2 875 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 STXBP2Q15833 593 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 PLTPP55058 493 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 VEPH1Q14D04 833 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 DR1Q01658 176 aa15.36■□□□□ 0.05
SMAD2-202ENST00000356825 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms