RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 REPS2Q8NFH8 660 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 DYDC2Q96IM9 177 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 SLITRK3O94933 977 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 CASP14P31944 242 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 DSG3P32926 999 aa20.45■□□□□ 0.86
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SPNS1-204ENST00000352260 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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SPNS1-204ENST00000352260 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 RLFQ13129 1914 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PQC6 194 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 BCRP11274 1271 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 TSG101Q99816 390 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 B4DLN1 442 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.43■□□□□ 0.86
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SPNS1-204ENST00000352260 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 DLK2Q6UY11 383 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 RIT2Q99578 217 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 REEP2Q9BRK0 252 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 RRAGCQ9HB90 399 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 DNM2P50570 870 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 IRAK1P51617 712 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 EPHA7Q15375 998 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.43■□□□□ 0.86
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SPNS1-204ENST00000352260 RNF146Q9NTX7 359 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 RIPK3Q9Y572 518 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.43■□□□□ 0.86
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SPNS1-204ENST00000352260 MIIPQ5JXC2 388 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.42■□□□□ 0.86
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SPNS1-204ENST00000352260 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB9Q96C00 473 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 JADE2Q9NQC1 790 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ADM5C9JUS6 153 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 CLSTN1O94985 981 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 MUTP22033 750 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 OAZ1P54368 228 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ERVK-24P63145 666 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 COG2Q14746 738 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 PGM5Q15124 567 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 NSMFQ6X4W1 530 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0U1RQJ8 604 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ANO9A1A5B4 782 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 KIF3CO14782 793 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.862e-16■□□□□ 8.1
SPNS1-204ENST00000352260 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 MAP2K2P36507 400 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ITIH3Q06033 890 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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