RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 P4HBP07237 508 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BCRP11274 1271 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SKIP12755 728 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA13P27216 316 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BCAR1P56945 870 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 IRF5Q13568 498 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SPECC1Q5M775 1068 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PLPP4Q5VZY2 271 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 XRRA1Q6P2D8 792 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 STAMQ92783 540 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC4Q96A65 974 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SNX25Q9H3E2 840 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KLK14Q9P0G3 267 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP11Q9UKA4 1901 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQY0 241 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD62A6NC57 917 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BNIP3LO60238 219 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 JAK2O60674 1132 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FSIP1Q8NA03 581 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 IQUBQ8NA54 791 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ST7Q9NRC1 585 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SPTLC1O15269 473 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN3O15551 220 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K13O43283 966 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 STAM2O75886 525 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS2P05162 132 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 P4HA1P13674 534 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GBP1P32455 592 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2J2P51589 502 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RABGGTBP53611 331 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EVX2Q03828 476 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BFSP1Q12934 665 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PALB2Q86YC2 1186 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GPRASP2Q96D09 838 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYM6O95789 1325 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1SQ13698 1873 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SFI1A8K8P3 1242 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BIN1O00499 593 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL14O95715 111 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 POMCP01189 267 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CD52P31358 61 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ANTXR2P58335 489 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PRKCEQ02156 737 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SCRN1Q12765 414 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DYDC2Q96IM9 177 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 INSL6Q9Y581 213 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 APC2O95996 2303 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DLL1O00548 723 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NPEPPSP55786 919 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TNNC1P63316 161 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TSPY1Q01534 308 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CAGE1Q8TC20 777 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MYLIPQ8WY64 445 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF333Q96JL9 665 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TRPC7Q9HCX4 862 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EMSYQ7Z589 1322 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms