RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L22D6RA61 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L19D6RCP7 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L20D6RJB6 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L24Q0WX57 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ORC6Q9Y5N6 252 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 USP17L10C9JJH3 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 MAML1Q92585 1016 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 STMN1P16949 149 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ACSL3O95573 720 aa24.03■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 DYDC2Q96IM9 177 aa24.03■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.03■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.03■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 INTUQ9ULD6 942 aa24.03■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 NNTQ13423 1086 aa24.03■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 LIFRP42702 1097 aa24.02■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ART3Q13508 389 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 KDM5CP41229 1560 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 MAP2K2P36507 400 aa24.02■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.01■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB7AO95365 584 aa24.01■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.01■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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PTPRM-201ENST00000332175 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24■■□□□ 1.43
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