RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321356.8

CLK1-201, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-201ENST00000321356 VAV3Q9UKW4 847 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 PLAAQ9Y263 795 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NFS1Q9Y697 457 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 FAM86B1E9PN63 330 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 F8W031 263 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 CCDC188H7C350 402 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NDUFAB1O14561 156 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 PPP1R37O75864 691 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 H2AFZP0C0S5 128 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ATP1A2P50993 1020 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 DDR1Q08345 913 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NFIAQ12857 509 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SLC15A2Q16348 729 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 PTGISQ16647 500 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NFIL3Q16649 462 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 PRR16Q569H4 304 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 H2AFVQ71UI9 128 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 METTL13Q8N6R0 699 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SEC14L1Q92503 715 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NCANO14594 1321 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 MEIS1O00470 390 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RIMBP2O15034 1052 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 CEP104O60308 925 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RSPH10BP0C881 870 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SLURP2P0DP57 97 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 HSD17B3P37058 310 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 CASP4P49662 377 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 GUCY1A3Q02108 690 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SLFN13Q68D06 897 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 VPS36Q86VN1 386 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 TEKT1Q969V4 418 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 HES6Q96HZ4 224 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SYT11Q9BT88 431 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 GCNT4Q9P109 453 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SAMM50Q9Y512 469 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.5□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 MSH4O15457 936 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 TGFB1I1O43294 461 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ERLIN2O94905 339 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 EYA4O95677 639 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 CYP3A4P08684 503 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 FERP16591 822 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 GAP43P17677 238 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 LIG3P49916 1009 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SCNN1DP51172 638 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NAA35Q5VZE5 725 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ICE2Q659A1 982 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 PEX26Q7Z412 305 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 KAT2BQ92831 832 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 LRRC45Q96CN5 670 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 AMNQ9BXJ7 453 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 GGA2Q9UJY4 613 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 OPLAHO14841 1288 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 ZNF844Q08AG5 666 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 KCNA1Q09470 495 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 GJB7Q6PEY0 223 aa9.49□□□□□ -0.89
CLK1-201ENST00000321356 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms