RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SNX24Q9Y343 169 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 POTEMA6NI47 508 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PDCLQ13371 301 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TTC13Q8NBP0 860 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MMEP08473 750 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 IQCB1Q15051 598 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SFR1Q86XK3 245 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GINM1Q9NU53 330 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH2Q12809 1159 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 KIF22Q14807 665 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SRGAP2O75044 1071 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CASP1P29466 404 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA9P43362 315 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ARL4CP56559 192 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 OXER1Q8TDS5 423 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 RPAINQ86UA6 219 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TTC1Q99614 292 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQC6 194 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CYP27B1O15528 508 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ASNSP08243 561 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 NPR1P16066 1061 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 HLFQ16534 295 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 KRT39Q6A163 491 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PSMA2P25787 234 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 COASYQ13057 564 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP36Q96G28 342 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2R1Q13018 1463 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L5A8MUK1 530 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TFDP2Q14188 446 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GRM4Q14833 912 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 WDR91A4D1P6 747 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SFI1A8K8P3 1242 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PRELPP51888 382 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ABI1Q8IZP0 508 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2D6P10635 497 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 KLC2Q9H0B6 622 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ATP8B3O60423 1300 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PALLDQ8WX93 1383 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5HO75947 161 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ART3Q13508 389 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MX2P20592 715 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CDC27P30260 824 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TTC25Q96NG3 672 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PRDX5P30044 214 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GGCXP38435 758 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TTC26A0AVF1 554 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1CO00159 1063 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 OSTNP61366 133 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MAML1Q92585 1016 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms