RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF12Q96FN5 646 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PASKQ96RG2 1323 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 AK9Q5TCS8 1911 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 FBXL13Q8NEE6 735 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM58Q8NG06 486 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 EGFL8Q99944 293 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 RASSF2P50749 326 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 OSBP2Q969R2 916 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TSKSQ9UJT2 592 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 HUNKP57058 714 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PTK2BQ14289 1009 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF667Q5HYK9 610 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD40Q6AI12 368 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 AGR3Q8TD06 166 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MORC4Q8TE76 937 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TEKT4Q8WW24 435 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHL14Q9P2G3 628 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP7AQ04656 1500 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 LZICQ8WZA0 190 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MAML1Q92585 1016 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPK6Q16659 721 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM270Q6UE05 265 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 METP08581 1390 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PFKFB2O60825 505 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 GCLMP48507 274 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SCARF1Q14162 830 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TXNRD1Q16881 649 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MCTP2Q6DN12 878 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM180AQ6UWF9 173 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM160B2Q86V87 743 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 HACL1Q9UJ83 578 aa12.75□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 RARBP10826 455 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PHKA2P46019 1235 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MXI1P50539 228 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM206Q9H813 350 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 EFCAB8A8MWE9 144 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF28PB7ZC32 967 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX11P35716 441 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 BPIFB4P59827 614 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 RMDN1Q96DB5 314 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CASS4Q9NQ75 786 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 GAP43P17677 238 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 BEST2Q8NFU1 509 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TCP11Q8WWU5 503 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ORC6Q9Y5N6 252 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PIK3C2GO75747 1445 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 BRINP3Q76B58 766 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 APOEP02649 317 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJC7Q99615 494 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CLTAP09496 248 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGDIAP52565 204 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM179Q6ZVK1 233 aa12.74□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 APOA5Q6Q788 366 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ERO1AQ96HE7 468 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 HAUS8Q9BT25 410 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 GTSE1Q9NYZ3 720 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 OR1G1P47890 313 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 USP33Q8TEY7 942 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PDGFRBP09619 1106 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TXNP10599 105 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 GALNT17Q6IS24 598 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC31Q6UY01 552 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP10DQ9P241 1426 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 IQCA1LA6NCM1 817 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 UBE3CQ15386 1083 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 P2RX5Q93086 422 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHL11Q9NVR0 708 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 FEM1BQ9UK73 627 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MINPP1Q9UNW1 487 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MXQ7 604 aa12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 E2F8A0AVK6 867 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms