RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 GNAT1P11488 350 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 COL6A2P12110 1019 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 UGT8Q16880 541 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MUM1Q2TAK8 710 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PPM1NQ8N819 430 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PHKBQ93100 1093 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PPM1MQ96MI6 270 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 ANO3Q9BYT9 981 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CERS4Q9HA82 394 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 RRN3Q9NYV6 651 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 OIP5O43482 229 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 DTNBO60941 627 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MAPK9P45984 424 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 RXRGP48443 463 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SLC5A3P53794 718 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 LAPTM5Q13571 262 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PRR16Q569H4 304 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 APOA5Q6Q788 366 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 TSPEARQ8WU66 669 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PDP2Q9P2J9 529 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.26□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 F8W735 103 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 NCAM2O15394 837 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 LPLP06858 475 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SYPP08247 313 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CCDC93Q567U6 631 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CCDC89Q8N998 374 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.25□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CCDC154A6NI56 674 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MGEA5O60502 916 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SNX2O60749 519 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MYF5P13349 255 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 MTHFD2P13995 350 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 FPR2P25090 351 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 FNTBP49356 437 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 ZNF543Q08ER8 600 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PPFIA1Q13136 1202 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 FAM209BQ5JX69 171 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 NAXEQ8NCW5 288 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 RAX2Q96IS3 184 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CD244Q9BZW8 370 aa7.24□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 PRSS38A1L453 326 aa7.23□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 EYA2O00167 538 aa7.23□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SDHAP31040 664 aa7.23□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 IL12RB1P42701 662 aa7.23□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 USP11P51784 963 aa7.23□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 SLC16A1P53985 500 aa7.23□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms