RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 ITGA4P13612 1032 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 UCHL3P15374 230 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ELF1P32519 619 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 EPS15P42566 896 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ADAM9Q13443 819 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L5A8MUK1 530 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 F8W031 263 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CETN3O15182 167 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SLC26A4O43511 780 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 MGRN1O60291 552 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 FLOT1O75955 427 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ACTN1P12814 892 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PEX26Q7Z412 305 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CEP95Q96GE4 821 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 HES6Q96HZ4 224 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CEP83Q9Y592 693 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 RGL2O15211 777 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TTI1O43156 1089 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PDHBP11177 359 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SLC9A1P19634 815 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PSEN1P49768 467 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 KRT71Q3SY84 523 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 COA7Q96BR5 231 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SPAG5Q96R06 1193 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CYP11B2P19099 503 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PON1P27169 355 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NF2P35240 595 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 JAM2P57087 298 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 HVCN1Q96D96 273 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.8□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 E9PMD0 336 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PPIP5K2O43314 1243 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NUDT17P0C025 328 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 H2AFZP0C0S5 128 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PLA2G4BP0C869 781 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NR2F2P24468 414 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 H2AFVQ71UI9 128 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SUFUQ9UMX1 484 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 BACH1O14867 736 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 MMP10P09238 476 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SLC8A1P32418 973 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TNNI2P48788 182 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GRIK5Q16478 980 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 HOOK3Q86VS8 718 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GPBP1Q86WP2 473 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 FMO2Q99518 471 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 MTFR1LQ9H019 292 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 LDHCP07864 332 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GSTA1P08263 222 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SNHG28P0DPA3 235 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms