RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 COPS5Q92905 334 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MYADML2A6NDP7 307 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC10P48553 1259 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFAIP2Q03169 654 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA3FQ13275 785 aa29.1■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR11Q9BZH6 1224 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 RMND1Q9NWS8 449 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 GYPCP04921 128 aa29.1■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 CASP14P31944 242 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO3Q9BYT9 981 aa29.1■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 CTAGE8P0CG41 777 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 RARBP10826 455 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MCM3P25205 808 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAGE6Q86UF2 777 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAGE4Q8IX94 777 aa29.09■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 L1RE1Q9UN81 338 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 AFMP43652 599 aa29.08■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 NEK11Q8NG66 645 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa29.08■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL10Q6JEL2 608 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 EPSTI1Q96J88 318 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM51Q9NW97 253 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH7BA7E2Y1 1941 aa29.07■■■□□ 2.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 M0R2N6 131 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 EDIL3O43854 480 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 SORBS3O60504 671 aa29.07■■■□□ 2.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC62Q6P9F0 684 aa29.07■■■□□ 2.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35F6Q8N357 371 aa29.05■■■□□ 2.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 CRYGNQ8WXF5 182 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BQF6 201 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 SREBF1P36956 1147 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 COPB1P53618 953 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 E2F4Q16254 413 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF662Q6ZS27 426 aa29.03■■■□□ 2.24
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