RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DNAJB1P25685 340 aa21.52■■□□□ 1.04
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPFIA1Q13136 1202 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.52■■□□□ 1.04
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.52■■□□□ 1.04
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.52■■□□□ 1.04
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.51■■□□□ 1.03
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.49■■□□□ 1.03
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.47■■□□□ 1.03
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 STK36Q9NRP7 1315 aa21.46■■□□□ 1.03
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTDNEP1O95476 244 aa21.45■■□□□ 1.02
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IER5Q5VY09 327 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 M0QZ92 97 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DTNBO60941 627 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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