RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q9DAQ4 598 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lypla2Q9WTL7 231 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc38A2VDH3 298 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp213E9QAW0 468 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnfrsf11aO35305 625 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tigd5Q499M4 642 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ago4Q8CJF8 861 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Msantd4Q91YU3 345 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubiad1Q9DC60 336 aa24.61■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dph1Q5NCQ5 438 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Scarf1Q5ND28 820 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FdxrQ61578 494 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Anks6Q6GQX6 883 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ctage5Q8R311 779 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rexo2Q9D8S4 237 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc40a1Q9JHI9 570 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TyrobpO54885 114 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gap43P06837 227 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp4P35123 962 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GopcQ8BH60 463 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lgi2Q8K4Z0 550 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bud13Q8R149 637 aa24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Osbpl9A2A8Z1 736 aa24.59■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DgkiD3YWQ0 1071 aa24.59■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atp13a4Q5XF90 1193 aa24.59■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q8BWG4 1187 aa24.59■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CrygnQ8VHL5 183 aa24.59■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm28510A0A087WP28 240 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ace3D0G895 737 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Jdp2P97875 163 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gdpd4Q3TT99 632 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q8C6G1 249 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GzmnQ920S1 248 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fthl17aQ9DAX0 182 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 C2cd2E9Q3C1 696 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cul4aQ3TCH7 759 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grik5Q61626 979 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam111aQ9D2L9 613 aa24.58■■□□□ 1.53
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrig3Q6P1C6 1117 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nyap1Q6PFX7 833 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eif3hQ91WK2 352 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nfu1Q9QZ23 255 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm8298J3QPI0 401 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf367Q0VDT2 340 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 YdjcQ14BV6 310 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zmym1Q3TJB1 983 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nt5c2Q3V1L4 560 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rgl1Q60695 768 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 E2f5Q61502 335 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Acat1Q8QZT1 424 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mettl13Q91YR5 698 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cul1Q9WTX6 776 aa24.57■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tagap1P0CAX8 505 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf354cQ571J5 560 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fgfr1opQ66JX5 399 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Def6Q8C2K1 630 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plekhg6Q8R0J1 787 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trex1Q91XB0 314 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cmtm5Q9D6G9 156 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tlr2Q9QUN7 784 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klhdc7aA2APT9 773 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam198bQ3UPI1 517 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clul1Q3ZRW6 464 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam173bQ9D1Z3 247 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ankrd2Q9WV06 328 aa24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm38392E9Q2A2 434 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mucl2P02815 138 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vars2Q3U2A8 1060 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bst2Q8R2Q8 172 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rasgef1cQ9D300 466 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grtp1Q9D3N8 359 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm28036V9GXJ1 658 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tp53P02340 387 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fgfr4Q03142 799 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trip13Q3UA06 432 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp2r5cQ60996 524 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sugp2Q8CH09 1067 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Appl2Q8K3G9 662 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Aipl1Q924K1 328 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Drap1Q9D6N5 205 aa24.55■■□□□ 1.52
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Idh1O88844 414 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.6 ms