RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	KCTD16	Q68DU8	428 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	UBR7	Q8N806	425 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	STIM2	Q9P246	746 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	VWA5A	O00534	786 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	OPLAH	O14841	1288 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	HDAC3	O15379	428 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ALAS1	P13196	640 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PRKACA	P17612	351 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SOX11	P35716	441 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	MTTP	P55157	894 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PHEX	P78562	749 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ZBTB16	Q05516	673 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	MAP2K5	Q13163	448 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ODF2	Q5BJF6	829 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	HERVK_113	Q902F9	699 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RADIL	Q96JH8	1075 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PARVB	Q9HBI1	364 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	KCND1	Q9NSA2	647 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SCOC	Q9UIL1	159 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	INSR	P06213	1382 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	MAP3K5	Q99683	1374 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	F13A1	P00488	732 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	GNAI3	P08754	354 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	IDO1	P14902	403 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINB3	P29508	390 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	STAT6	P42226	847 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RAC1	P63000	192 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	APBA1	Q02410	837 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	KDSR	Q06136	332 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	KIF5A	Q12840	1032 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	STX1A	Q16623	288 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	NAA35	Q5VZE5	725 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SARM1	Q6SZW1	724 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM228A	Q86W67	206 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	FBF1	Q8TES7	1133 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PNKP	Q96T60	521 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	APOL5	Q9BWW9	433 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	EBF2	Q9HAK2	575 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CRLF2	Q9HC73	371 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	MYPN	Q86TC9	1320 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RIPK2	O43353	540 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	LARGE1	O95461	756 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	NPTXR	O95502	500 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	HEXB	P07686	556 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	WEE1	P30291	646 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SOX5	P35711	763 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF76	P36508	570 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CAP2	P40123	477 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD52	P43351	418 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CFAP100	Q494V2	611 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TMC4	Q7Z404	712 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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