RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	KRT15	P19012	456 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	AOAH	P28039	575 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	JAM2	P57087	298 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	FOXE3	Q13461	319 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652		Q6ZSN1	163 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	INCENP	Q9NQS7	918 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	BTBD7	Q9P203	1132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	MATN2	O00339	956 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	NAT1	P18440	290 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	HERVK_113	P62684	666 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	GABRE	P78334	506 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ST5	P78524	1137 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	KLF10	Q13118	480 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	DUSP8	Q13202	625 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	STIL	Q15468	1287 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CRY1	Q16526	586 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	TBR1	Q16650	682 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	MIIP	Q5JXC2	388 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	WNK4	Q96J92	1243 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	EXOC2	Q96KP1	924 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	FBXO10	Q9UK96	956 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	NR2E1	Q9Y466	385 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	KCNK3	O14649	394 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	GSTA4	O15217	222 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CDC14B	O60729	498 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CRTAM	O95727	393 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	HMGCR	P04035	888 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	MC4R	P32245	332 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ADCY8	P40145	1251 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	NFYC	Q13952	458 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF503	Q96F45	646 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	MENT	Q9BUN1	341 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	PLSCR1	O15162	318 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ARHGAP6	O43182	974 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	MPIG6B	O95866	241 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	DNM2	P50570	870 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	KCNQ1	P51787	676 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	SEC23A	Q15436	765 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	CFHR4	Q92496	578 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	EXTL1	Q92935	676 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	AMN	Q9BXJ7	453 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF559-209	ENST00000591652	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	NBPF4	Q96M43	638 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	OR14A2	Q96R54	314 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	ECE1	P42892	770 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	CD83	Q01151	205 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	KANK2	Q63ZY3	851 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF559-209	ENST00000591652	USP30	Q70CQ3	517 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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