RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 YME1L1Q96TA2 773 aa25.52■■□□□ 1.68
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CLN3-232ENST00000568443 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.52■■□□□ 1.68
CLN3-232ENST00000568443 LPXNO60711 386 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 PRR16Q569H4 304 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 ZNF302Q9NR11 478 aa25.51■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 M0QZ92 97 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 HBP1O60381 514 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 STK3Q13188 491 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.5■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.5■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.49■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.49■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 KLRC1P26715 233 aa25.48■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.48■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 IL27Q8NEV9 243 aa25.48■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.48■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 ENPP3O14638 875 aa25.47■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 KRT76Q01546 638 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 SAMD11Q96NU1 681 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.47■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 SQORQ9Y6N5 450 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 PSAPP07602 524 aa25.46■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 CD52P31358 61 aa25.46■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 AAK1Q2M2I8 961 aa25.46■■□□□ 1.67
CLN3-232ENST00000568443 IL17RAQ96F46 866 aa25.46■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.46■■□□□ 1.67
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CLN3-232ENST00000568443 EPC2Q52LR7 807 aa25.44■■□□□ 1.66
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CLN3-232ENST00000568443 BLIDQ8IZY5 108 aa25.44■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 TBCKQ8TEA7 893 aa25.44■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 MSH4O15457 936 aa25.43■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 GALNT17Q6IS24 598 aa25.43■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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CLN3-232ENST00000568443 FTHL17Q9BXU8 183 aa25.43■■□□□ 1.66
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CLN3-232ENST00000568443 WDR64B1ANS9 1081 aa25.42■■□□□ 1.66
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CLN3-232ENST00000568443 TMEM192Q8IY95 271 aa25.42■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.42■■□□□ 1.66
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CLN3-232ENST00000568443 GINS2Q9Y248 185 aa25.42■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 GAS7O60861 476 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 ANAPC15P60006 121 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 DISC1Q9NRI5 854 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 TTC3P53804 2025 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 EVPLQ92817 2033 aa25.41■■□□□ 1.66
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