RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 CPT1AP50416 773 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SLC26A2P50443 739 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 UGCGQ16739 394 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 DGKDQ16760 1214 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 CNNM3Q8NE01 707 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 AZI2Q9H6S1 392 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 E9PMD0 336 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 CTAGE5O15320 804 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF862O60290 1169 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 STBD1O95210 358 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 PSMC6P62333 389 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 KAT6AQ92794 2004 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SPC25Q9HBM1 224 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 ARID2Q68CP9 1835 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 KPNA6O60684 536 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 LGALS2P05162 132 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 ATP4AP20648 1035 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 XKR3Q5GH77 459 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SV2BQ7L1I2 683 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 PAGE5Q96GU1 130 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 TNMDQ9H2S6 317 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-210ENST00000568388 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ADAMTS4O75173 837 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 PLA2G4BP0C869 781 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 GLG1Q92896 1179 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF333Q96JL9 665 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 BRCA2P51587 3418 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 OATP04181 439 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 MYL1P05976 194 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 SLC12A3P55017 1021 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 AMPD3Q01432 767 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 PRKCEQ02156 737 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 MCM6Q14566 821 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 LHX8Q68G74 356 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 FAM167AQ96KS9 214 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 MTRQ99707 1265 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 A0A087WWV3 80 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB39O15060 712 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ZEB2O60315 1214 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ANO5Q75V66 913 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 PPME1Q9Y570 386 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 H3BRB1 525 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 RARRES1P49788 294 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 PLCB4Q15147 1175 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 KCND2Q9NZV8 630 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.86■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 MYH11P35749 1972 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 MYADML2A6NDP7 307 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-210ENST00000568388 HBP1O60381 514 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms