RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 MMP1P03956 469 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 FAM26DQ5JW98 314 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 DISC1Q9NRI5 854 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 KIF28PB7ZC32 967 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 M0QZ92 97 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 ST3GAL1Q11201 340 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 MBTPS1Q14703 1052 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 OXER1Q8TDS5 423 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 SEPT8Q92599 483 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 APBB2Q92870 758 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 FAM161BQ96MY7 647 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.42■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 DTNBO60941 627 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 PSMD10O75832 226 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 PBX2P40425 430 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 IER5Q5VY09 327 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 KRT40Q6A162 431 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 FAM20AQ96MK3 541 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF576Q9H609 170 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 TBX3O15119 743 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 CHMP2AO43633 222 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 NR5A1Q13285 461 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM3-211ENST00000565922 MARCH6O60337 910 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 NME8Q8N427 588 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 C8orf76Q96K31 380 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 GUCD1Q96NT3 240 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 MYO9BQ13459 2157 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 SLC37A4O43826 429 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 MCM2P49736 904 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 TNFRSF25Q93038 417 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 KIF3AQ9Y496 699 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 SQORQ9Y6N5 450 aa22.38■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 BTBD18B2RXH4 712 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 CHRNA1P02708 482 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 AMHP03971 560 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 OATP04181 439 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 ATP4AP20648 1035 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 KLRC1P26715 233 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 FOSBP53539 338 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 RABGGTBP53611 331 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 MGAT3Q09327 533 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 USP38Q8NB14 1042 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 MAGEB2O15479 319 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 PRKCEQ02156 737 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 PPP2R5CQ13362 524 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 GJA10Q969M2 543 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 TLL1O43897 1013 aa22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.34■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 GHRP10912 638 aa22.34■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 DEFB103AP81534 67 aa22.34■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CMTM3-211ENST00000565922 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.34■■□□□ 1.17
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