RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 YME1L1Q96TA2 773 aa25.52■■□□□ 1.68
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CLN3-215ENST00000565236 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.52■■□□□ 1.68
CLN3-215ENST00000565236 LPXNO60711 386 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 PRR16Q569H4 304 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 ZNF302Q9NR11 478 aa25.51■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 STK3Q13188 491 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.5■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.5■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.49■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 SAMD11Q96NU1 681 aa25.47■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 SQORQ9Y6N5 450 aa25.47■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 CD52P31358 61 aa25.46■■□□□ 1.67
CLN3-215ENST00000565236 AAK1Q2M2I8 961 aa25.46■■□□□ 1.67
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CLN3-215ENST00000565236 TBCKQ8TEA7 893 aa25.44■■□□□ 1.66
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CLN3-215ENST00000565236 GALNT17Q6IS24 598 aa25.43■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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CLN3-215ENST00000565236 FTHL17Q9BXU8 183 aa25.43■■□□□ 1.66
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CLN3-215ENST00000565236 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.41■■□□□ 1.66
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CLN3-215ENST00000565236 ANAPC15P60006 121 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 DISC1Q9NRI5 854 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 TTC3P53804 2025 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 EVPLQ92817 2033 aa25.41■■□□□ 1.66
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