RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.23□□□□□ -0.93
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ATXN3-216ENST00000545170 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.23□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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ATXN3-216ENST00000545170 TRIM49CP0CI26 452 aa9.22□□□□□ -0.93
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ATXN3-216ENST00000545170 TSPYL6Q8N831 410 aa9.22□□□□□ -0.93
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ATXN3-216ENST00000545170 DAPK1P53355 1430 aa9.21□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 P4HA2O15460 535 aa9.21□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 VAMP4O75379 141 aa9.21□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 GFPT2O94808 682 aa9.21□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 P4HA1P13674 534 aa9.21□□□□□ -0.93
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