RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CAMK4Q16566 473 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF333Q96JL9 665 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 STBD1O95210 358 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 CASP1P29466 404 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 CPT1AP50416 773 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ANO5Q75V66 913 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 IQUBQ8NA54 791 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
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TSNARE1-208ENST00000524325 AFMP43652 599 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 NPEPPSP55786 919 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 NEK9Q8TD19 979 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 MTRQ99707 1265 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 SPC25Q9HBM1 224 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAK2O60296 914 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNA10Q16322 511 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 CNNM3Q8NE01 707 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD54LQ92698 747 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 KAT2BQ92831 832 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 POLD4Q9HCU8 107 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 DNM3Q9UQ16 869 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 STK24Q9Y6E0 443 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 C4orf19Q8IY42 314 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BRB1 525 aa25.39■■□□□ 1.66
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TSNARE1-208ENST00000524325 PLCB4Q15147 1175 aa25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC41Q15345 812 aa25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 NACC1Q96RE7 527 aa25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 EMSYQ7Z589 1322 aa25.39■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.39■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 OATP04181 439 aa25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 SLFN14P0C7P3 912 aa25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 PLA2G4BP0C869 781 aa25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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TSNARE1-208ENST00000524325 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.38■■□□□ 1.65
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TSNARE1-208ENST00000524325 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPC6Q9Y210 931 aa25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.37■■□□□ 1.65
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TSNARE1-208ENST00000524325 ASGR1P07306 291 aa25.37■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR29P0C7W0 189 aa25.37■■□□□ 1.65
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TSNARE1-208ENST00000524325 MTERF2Q49AM1 385 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 XKR9Q5GH70 373 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 EYA4O95677 639 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC12A3P55017 1021 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 IGBP1P78318 339 aa25.36■■□□□ 1.65
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TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.36■■□□□ 1.65
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TSNARE1-208ENST00000524325 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF180Q86T96 592 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP170P1Q96L14 293 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 STK17AQ9UEE5 414 aa25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 F2P00734 622 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 RARRES1P49788 294 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 PNOCQ13519 176 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 NKX3-2P78367 333 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 MYMKA6NI61 221 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC26A4O43511 780 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 SOX10P56693 466 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 MFSD10Q14728 455 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-208ENST00000524325 ARSHQ5FYA8 562 aa25.34■■□□□ 1.65
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