RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498478.1

ITGB6-210, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB6, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-210ENST00000498478 TPH2Q8IWU9 490 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CPA6Q8N4T0 437 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TRIM75PA6NK02 468 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 SRGAP3O43295 1099 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ADAMTS4O75173 837 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PF4V1P10720 104 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GNALP38405 381 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GBP4Q96PP9 640 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ANO3Q9BYT9 981 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 KLHL33A6NCF5 533 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ADCY1Q08828 1119 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ACAP2Q15057 778 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ASB15Q8WXK1 588 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 RNF32Q9H0A6 362 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 NUDT19A8MXV4 375 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 WNT11O96014 354 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 KRT85P78386 507 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CT83Q5H943 113 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 TMEM240Q5SV17 173 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 NME9Q86XW9 330 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ABHD4Q8TB40 342 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ACAP3Q96P50 834 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 FAHP16930 419 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ERVFRD-1P60508 538 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 HERVK_113P62684 666 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 HTRA3P83110 453 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PRR5P85299 388 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 HIPK4Q8NE63 616 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ORAI2Q96SN7 254 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 POFUT1Q9H488 388 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 INVSQ9Y283 1065 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ZBTB7AO95365 584 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 MPOP05164 745 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ENPP1P22413 925 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 MOGSQ13724 837 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 NR1I3Q14994 352 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 TOR2AQ5JU69 321 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 C7orf31Q8N865 590 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 JADE3Q92613 823 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 TEKT5Q96M29 485 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 EDARQ9UNE0 448 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 CAND2O75155 1236 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 APOL3O95236 402 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 IL33O95760 270 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ITGB6-210ENST00000498478 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms