RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SCG2P13521 617 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 HADHAP40939 763 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF165P49910 485 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GPR85P60893 370 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 DCAF7P61962 342 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PDE4BQ07343 736 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 DBN1Q16643 649 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC80Q76M96 950 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 CEP68Q76N32 757 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM110Q86TL2 294 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 NLRP10Q86W26 655 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ESX1Q8N693 406 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 UCMAQ8WVF2 138 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 RHOVQ96L33 236 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 CDC6Q99741 560 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 RNF38Q9H0F5 515 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.06□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ADCY3O60266 1144 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ADAMTS4O75173 837 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 CFBP00751 764 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 OPN1MWP04001 364 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GZMAP12544 262 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 EPS15P42566 896 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SLC12A2P55011 1212 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ARL4CP56559 192 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 KRT85P78386 507 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ADAM15Q13444 863 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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PDCD4-211ENST00000498367 SLC6A19Q695T7 634 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 NLRP13Q86W25 1043 aa8.05□□□□□ -1.12
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PDCD4-211ENST00000498367 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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PDCD4-211ENST00000498367 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 VPS39Q96JC1 886 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf74Q96LT6 269 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PIGSQ96S52 555 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.05□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0B4J269 797 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC14BA6NHZ5 514 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 F8VZ95 297 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 H0Y626 953 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 H0YHG0 523 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 K7ESF4 209 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 IRAK2O43187 625 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GOSR1O95249 250 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 TBX18O95935 607 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PPM1AP35813 382 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ALDH3A2P51648 485 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 FOXK2Q01167 660 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 IL1RL1Q01638 556 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SLC7A5Q01650 507 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 SEZ6Q53EL9 994 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 PI16Q6UXB8 463 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 OR2C3Q8N628 320 aa8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PDCD4-211ENST00000498367 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.04□□□□□ -1.12
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