RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490812.5

PTPN18-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN18, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-215ENST00000490812 TOP1MTQ969P6 601 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPN18-215ENST00000490812 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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PTPN18-215ENST00000490812 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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PTPN18-215ENST00000490812 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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PTPN18-215ENST00000490812 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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PTPN18-215ENST00000490812 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.11■■□□□ 1.45
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PTPN18-215ENST00000490812 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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PTPN18-215ENST00000490812 AIFM3Q96NN9 605 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.1■■□□□ 1.45
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PTPN18-215ENST00000490812 FAM167AQ96KS9 214 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 SAMD11Q96NU1 681 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.09■■□□□ 1.45
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PTPN18-215ENST00000490812 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN18-215ENST00000490812 ENPP3O14638 875 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPN18-215ENST00000490812 CD52P31358 61 aa24.07■■□□□ 1.44
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