RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 SQORQ9Y6N5 450 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 NCOR1O75376 2440 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 FAM86B1E9PN63 330 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 DGKIO75912 1065 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 CCNE2O96020 404 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 KLRC1P26715 233 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 NEK9Q8TD19 979 aa21.92■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.91■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.91■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 PAK2Q13177 524 aa21.91■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.91■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.91■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 Q6ZUG5 572 aa21.91■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.9■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.9■■□□□ 1.1
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SHQ1-206ENST00000471526 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 ESYT2A0FGR8 921 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 ATP4AP20648 1035 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 LTBRP36941 435 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 GATMP50440 423 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.86■■□□□ 1.09
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