RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-222	ENST00000459758	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	OPLAH	O14841	1288 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	MAFG	O15525	162 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBED4	O75132	1171 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	NR3C1	P04150	777 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	DPEP1	P16444	411 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGER2	P43116	358 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	OAZ1	P54368	228 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNH2	Q12809	1159 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC41	Q15345	812 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	CLUL1	Q15846	466 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ARSH	Q5FYA8	562 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC174	Q6PII3	467 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SFR1	Q86XK3	245 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	BAP1	Q92560	729 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	HPS3	Q969F9	1004 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SPAG5	Q96R06	1193 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	INTU	Q9ULD6	942 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	RPTOR	Q8N122	1335 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	RASSF10	A6NK89	507 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	CES2	O00748	559 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPK13	O15264	365 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	STAM2	O75886	525 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	FLOT1	O75955	427 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	LYPLA2	O95372	231 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	STAT3	P40763	770 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ECE1	P42892	770 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	JAK3	P52333	1124 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF131	P52739	623 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	RASA3	Q14644	834 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC181	Q5TID7	509 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	USP37	Q86T82	979 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	MYCT1	Q8N699	235 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	HVCN1	Q96D96	273 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	JADE2	Q9NQC1	790 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	WNT10B	O00744	389 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	FANCG	O15287	622 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	P4HA2	O15460	535 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SLITRK3	O94933	977 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	CLSTN1	O94985	981 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	FER	P16591	822 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKCI	P41743	596 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT76	Q01546	638 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	CXCL9	Q07325	125 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	TKFC	Q3LXA3	575 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	TPH2	Q8IWU9	490 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ACER1	Q8TDN7	264 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D5	Q92609	795 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	DRC1	Q96MC2	740 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX12	Q9UMY4	172 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	C19orf81	C9J6K1	198 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758		H0YCG3	227 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT13	P13646	458 aa		12.61	□□□□□ -0.39

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