RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP1-204ENST00000459646 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP1-204ENST00000459646 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP1-204ENST00000459646 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 GJD3Q8N144 294 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 BICD2Q8TD16 824 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SCLT1Q96NL6 688 aa9.71□□□□□ -0.86
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