RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 MOCS3O95396 460 aa30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 IQCEQ6IPM2 695 aa30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 MIGA2Q7L4E1 593 aa30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 WDR11Q9BZH6 1224 aa30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 PGAP2Q9UHJ9 254 aa30.39■■■□□ 2.46
CERS1-201ENST00000429504 GCNT3O95395 438 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 AFPP02771 609 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 NR3C1P04150 777 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ASNSP08243 561 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 C1orf186Q6ZWK4 172 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 LDHDQ86WU2 507 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 TPH2Q8IWU9 490 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 DYDC2Q96IM9 177 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 MCM3P25205 808 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 NIM1KQ8IY84 436 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 PIGOQ8TEQ8 1089 aa30.38■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 FRMPD4Q14CM0 1322 aa30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 CAGE1Q8TC20 777 aa30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 FAM13AO94988 1023 aa30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 DPEP1P16444 411 aa30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 GPIHBP1Q8IV16 184 aa30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 KCND2Q9NZV8 630 aa30.37■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ZNF185O15231 689 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 CHMP2AO43633 222 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 AKAP3O75969 853 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 EPB41P11171 864 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 RAPGEF1Q13905 1077 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 SLC18A3Q16572 532 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 NOX5Q96PH1 765 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 FBXO28Q9NVF7 368 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 PTGER2P43116 358 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 UBXN2AP68543 259 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 APBA1Q02410 837 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 RASSF7Q02833 373 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ITIH3Q06033 890 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 NFIL3Q16649 462 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 B3GNT9Q6UX72 402 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 SEL1LQ9UBV2 794 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
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CERS1-201ENST00000429504 CREG2Q8IUH2 290 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 NACC1Q96RE7 527 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 PARVGQ9HBI0 331 aa30.35■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 SALL4Q9UJQ4 1053 aa30.35■■■□□ 2.45
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CERS1-201ENST00000429504 SLC30A10Q6XR72 485 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 PRDM4Q9UKN5 801 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ICAM1P05362 532 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ZNF131P52739 623 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 KLHL30Q0D2K2 578 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 EPHA7Q15375 998 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 EXOC3L4Q17RC7 722 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 TEKT3Q9BXF9 490 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 HYOU1Q9Y4L1 999 aa30.34■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 WNT10BO00744 389 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 MYCT1Q8N699 235 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 FAM133AQ8N9E0 248 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 RIT2Q99578 217 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 UNC45AQ9H3U1 944 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 FBXL5Q9UKA1 691 aa30.33■■■□□ 2.45
CERS1-201ENST00000429504 SHTN1A0MZ66 631 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 TGFB1I1O43294 461 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 ARP10275 920 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 UCHL3P15374 230 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 OSBPL9Q96SU4 736 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 BCAS3Q9H6U6 928 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 ODF2LQ9ULJ1 636 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 PON1P27169 355 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 KCNA1Q09470 495 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 CCDC125Q86Z20 511 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 SLC35C1Q96A29 364 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 TSKSQ9UJT2 592 aa30.32■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 SFI1A8K8P3 1242 aa30.31■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 BCRP11274 1271 aa30.31■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 SLC9A1P19634 815 aa30.31■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 POLD1P28340 1107 aa30.31■■■□□ 2.44
CERS1-201ENST00000429504 CXCL9Q07325 125 aa30.31■■■□□ 2.44
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